病例材料
患者：男，5岁
临床体现：血碱性磷酸酶IU/L↑，血磷0.7mmol/L↓，血钙2.27mmol/L（寻常），25-羟维生素D25.52ng/mL（寻常）
临床诊断：佝偻病
家属史：无
基因探测：送检未一医学全外显子测序剖析（WES）
基因探测成效：NGS成效提醒受检者Chr3与ChX染色体间也许产平生衡易位：46,XY,t(3;X)(q27;p22)？，变异打断PHEX基因，使其失活，PHEX基因变异可致使X连锁显性低磷性佝偻病（MIM：）
临床音信开采对遗传解读的要害性
施行WES剖析过程
数据下机后经过WES剖析过程，未觉察疑忌变异。
研究：先证者为幼儿起病，佝偻病病因不明，遗传性病因不能清除，可否直接断定为阴性汇报？
未一解读老手组复盘剖析
针对存疑案例，未片时启动由高等遗传磋商师与多位资深临床医师构成的解读老手组开展议论会：
?该案例并未汇集到详细的病历，仅供给该通例探测成效，无其余表型根据；
?WES剖析过程显示未觉察疑忌致病性变异；
?当通例过程阴性，然则高度猜疑为遗传病时，解读老手会琢磨人为稽核BAM文献来进一步确认临床变异数据解读的的确性和活络度，但针对本例汇报，举行佝偻病相干基因波及BAM所有观察无异于铁树开花；
?未一老手组医师贯串患者血生化反常目标（血碱性磷酸酶IU/L↑；血磷0.7mmol/L↓），且血钙及25羟维生素D探测成效寻常，临床诊断佝偻病相干临床音信，提醒该患者也许为低磷性佝偻病；
?解读老手遵循提醒线索将标的锁定于下列5类也许引发低磷性佝偻病的基因，终究果真觉察Chr3与ChrX间产平生衡易位：46,XY,t(3;X)(q27;p22)？，而该变异也许致使PHEX基因反常；
?该变异属于布局变异（SV），WES过程要紧合用于探测SNV/InDel/CNV，且外显子测序基因间区正常无探针遮盖，因而施行通例WES剖析过程成效阴性。针对NGS探测技巧的控制性，解读老手组倡议采用其余法子进上进一步考证，如WGS、核型探测、染色体荧光原位杂交技巧（FISH）等，襄理疾病的诊断。
变异考证
推测也许的变异样子：
1、ChrX、Chr3间易位
2、Chr3片断插入ChrX
3、其余（ChrX倒位，转座子等）
采取Sanger进一步考证，成效显示先证者ChX反常，Sanger成效人为比对找到Chr3与ChrX断点，终究觉察受检者Chr3与ChrX间产平生衡易位：46,XY,t(3;X)(q27;p22)？，变异打断PHEX基因，使其失活，PHEX基因变异可致使X连锁显性低磷性佝偻病。
X连锁显性遗传性低磷血症性佝偻病
疾病讲解：X连锁显性遗传性低磷血症性佝偻病为难得的遗传病，是低磷血症性佝偻病最难得的范例，罹病率约为1/。致使X连锁显性遗传性低磷血症性佝偻病的病由于X染色体p22.1上的内肽酶同源的磷酸盐调治基因（PHEX）致病渐变，PHEX基因包罗22个外显子，编码由个氨基酸构成的糖卵白，要紧在骨和牙齿中表白，该基因渐变可引发低磷血症、1,25-(OH)2D不足和骨代谢阻碍等一系列临床体现。
临床体现：患者轻重不同，临床体现各类，有显然的临床异质性，患儿常在诞生后未几即涌现低磷血症，如无精确家属史，多在幼儿期最先步行、骨骼慢慢负重后才被觉察，女性患者多于男性。
肌肉骨骼反常
童子期要紧体现为身段弱小，高低部量比例反常，下肢短，骨骼无理：（1）下肢无理，高产生在膝关节左近，难得膝内翻、膝外翻、胫骨改变、胫骨股骨屈曲等；（2）胸廓无理，要紧体现为肋串珠、鸡胸、漏斗胸；（3）颅骨软化、方颅、脊柱侧弯等；（4）骨痛及运动受限病症；（5）特别步态，步态不稳或步态摇动。
成人期要紧体现为身段弱小、骨关节炎、依附病（肌腱、韧带和关节囊钙化）和（或）骨赘。椎管狭隘是一种难得且严峻的晚期并发症，可致剧痛并严峻影响平常运动本领。很多停用磷酸盐和骨化三醇医治的成人患者存在肌无力、劳累、骨痛和步态反常等病症。
其余临床特点包罗
（1）牙质矿化弊端，要紧体现有牙脓肿、釉质发育不全、蛀牙、牙齿摆列不齐和年老成人牙齿过早零落等。
（2）颅缝早闭和其余颅面反常。
（3）成年后有轻至中度听力损失，偶有耳鸣和梅尼埃病，也许由于耳囊的骨软化症延宕而至。
（4）不少患者有高血压，但尚不明晰是由于疾病自己仍然医治引发。
基因探测：PHEX基因渐变是确诊X连锁显性遗传性低磷血症性佝偻病的要害根据，约87%家属性和72%散病发例存在PHEX渐变。迄今为止，人类基因渐变数据库（HGMD，